Az Egyházmegyei Elnökséget az esperes és a főgondnok, vagy a gondnok alkotja.

Az Egyházmegyei Tanács az egyházmegye kormányzati és igazgatási hatósága a közgyűlések közötti időszakban. A Kolozsvári Református Egyházmegye Tanácsának 10 választott tagja van.

Az Egyházmegyei Közgyűlés az egyházmegye legfőbb képviseleti és kormányzati testülete. A Kolozsvári Református Egyházmegye Közgyűlésének 91 alkotó tagja van.

Az Egyházmegyei Fegyelmi Bizottság tagjait az Egyházmegyei Közgyűlés választja. A Kolozsvári Református Egyházmegye Fegyelmi Bizottságának jelenleg 5 tagja és 3 póttagja van.